L’analyse d’échantillons obtenus lors d’une expédition dans l’océan Arctique suggère que les microbes marins pourraient constituer une nouvelle source prometteuse d’antibiotiques. Les scientifiques ont découvert que des substances produites par les microbes de l’océan Arctique, appelés actinobactéries, peuvent stopper la croissance de bactéries nocives et les empêcher de provoquer des maladies.
Environ 70 % des antibiotiques existants ont été trouvés dans des actinobactéries, dont la plupart vivent dans le sol terrestre. Cependant, les bactéries deviennent de plus en plus résistantes aux antibiotiques existants, ce qui signifie que de nouveaux médicaments sont nécessaires de toute urgence.
Les chercheurs se sont donc tournés vers les actinobactéries marines à la recherche de nouveaux antibiotiques. On pense que les microbes marins produisent une gamme de composés chimiquement plus diversifiée que leurs homologues terrestres. Cela est dû à la pression sélective créée par les fluctuations extrêmes de pression, de température, de concentration en sel et de niveaux de lumière qui se produisent dans l’environnement marin.
Dans une nouvelle étude, les scientifiques ont analysé des centaines de composés inconnus extraits d’actinobactéries vivant à l’intérieur des invertébrés. Les échantillons ont été collectés lors d’une expédition dans l’océan Arctique en 2020. Plus précisément, ils ont testé comment les composés affectaient un type pathogène d’E. coli appelé E. coli entéropathogène (EPEC). Ces bactéries infectent les cellules intestinales et provoquent de graves diarrhées, notamment chez les enfants.
Les scientifiques ont ensuite examiné si les composés produits par quatre espèces d’actinobactéries pourraient empêcher les bactéries EPEC d’infecter les cellules cultivées en laboratoire. Ils ont découvert que deux composés possédaient des propriétés antibactériennes particulièrement fortes : l’un provenant d’une souche d’actinobactéries du genre Rhodococcus et l’autre d’une souche appartenant au genre Kocuria. Ils ont décrit leurs découvertes dans un article publié le 30 août dans la revue Frontiers in Microbiology.
Les scientifiques ont découvert que ces composés empêchent les bactéries EPEC de se fixer à la surface de la cellule et d’introduire des substances qui permettent aux microbes de détourner sa machinerie moléculaire et de provoquer des maladies.
Cependant, alors que la bactérie Kocuria produisait des composés qui ralentissaient la croissance des bactéries EPEC, ce n’était pas le cas du composé de la bactérie Rhodococcus. Si les bactéries sont vivantes mais inoffensives pour l’hôte, la pression de sélection les pousse à développer une résistance au composé. Ainsi, le composé Rhodococcus pourrait être un candidat plus prometteur pour un nouvel antibiotique, a indiqué l’équipe dans un communiqué.
Beaucoup de travail reste à faire avant que l’un de ces composés soit mis sur le marché.
“Jusqu’à présent, nous n’avons mené que des études in vitro, nous sommes donc encore très loin de savoir si ces composés ont une réelle importance en termes d’utilisation clinique”, a déclaré Päivi Tammela, co-auteur de l’étude et professeur, à Live Science in Pharmaceutical Biology. de l’Université d’Helsinki en Finlande.
Par exemple, a déclaré Tammela, un grand défi réside dans la nécessité de trouver un moyen de produire de grandes quantités de ces composés, ce qui permettra aux scientifiques d’étudier leur structure et leur activité biologique plus en détail. Cependant, l’équipe fonde de grands espoirs sur l’avenir de cette recherche, et Tammela affirme qu’il est «absolument» possible qu’il existe de nombreux autres composés similaires attendant d’être découverts dans les profondeurs de la Terre.
